保健科学部は、春日キャンパスにある視覚障害学生のための学部です。鍼灸学専攻と理学療法学専攻の2つの専攻のある保健学科と情報システム学科で構成されており、附属東西医学統合医療センターが併設されています。各学科?専攻の定員は以下のようになっています。

「保健科学部の構成」

学部	学科	専攻	入学定員	卒業時の学位
保健科学部	保健学科	鍼灸学専攻	10名	学士 （鍼灸学）
		理学療法学専攻	10名	学士 （理学療法学）
	情報システム学科		10名	学士 （工学）

各学科?専攻での専門教育とは別に学部全体の基礎教育は障害者高等教育研究支援センターの障害者基礎教育研究部（視覚障害系部門）が担当しています。同部の教職課程部門が担当する教職課程を選択することも可能です。また同センターの障害者支援研究部も教育?研究両面で学部に携わっています。